V termínu 24. - 25. 5. 2007 byl proveden metodický dohled pracovníky oddělení finančních služeb MMR. Z hlediska metodiky vedení účetnictví nebyly zjištěny významné nedostatky ani závady.
Dále pak proběhla následná kontrola opatření k odstranění zjištěných nedostatků z provedené kontroly u ÚÚR Brno za období od l. 7.2003 do 31.3.2006 odborem kontroly MMR.
Dne 17. 12. 2007 byla provedena pracovníky Samostatného oddělení interního auditu MMR kontrola účinnosti vnitřního kontrolního systému v rámci vnitřního provozního a finančního řízení organizace ve smyslu zákona č. 320/2001 Sb. § 29 odst. 5 a § 30 odst.7 o finanční kontrole ve veřejné správě.
V rámci vlastního kontrolního systému byly provedeny prověrky pokladny, nákupu softwaru a prověřeny namátkově položky v seskupení 516.